海水缸柏林系統的根本即整個系統運作的原理——海水缸柏林系統運作原理是利用活石自帶的菌種和縫隙配上水流來培養硝化菌和厭氧細菌~用來保持系統平衡，過濾的好處就是拋棄了傳統濾材，減少了廢物的堆積，是海水魚友認可的主海水缸系統，因其相對低成本，算是一次性投入，可長期運行的系統，故被大部分人推崇。它被描述成為一個高效的去除營養鹽，改善水質，保持生物多樣性的水族工程。也被稱為自然法養魚!
海水缸柏林系統的關鍵設備——海水缸柏林系統的核心是適量高品質的活石和高功率的蛋白分離器——高品質的活石有大量微細的空洞，里面孳生著大量的菌群，其作用是培養硝化細菌和一些厭氧菌!高功率蛋白分離器的作用是將各種途徑產生的蛋白質分離出水體，減少NO2、NO3的產生!除以上兩點核心外也需要強大的造浪，且無死角以及強大的光照系統維持海水缸內生物的正常生長!
海水缸柏林系統簡單來說就是利用活石上的細菌和藻類維持整個海水缸生態系統平衡，而蛋分，光照，水流都是為此系統不可或缺的輔助作用，海水缸柏林系統核心的核心就是活石!