錦鯉可以分為九大品系，大概有一百多個品種。根據錦鯉種的來源可以分為革鯉、緋鯉、鏡鯉三種，但是根據錦鯉的顏色、鱗片、花紋的分布情況，大概有13個品種。最常見的是紅白錦鯉，純正的紅白錦鯉全體是白色底，帶有紅色的花斑，無雜色。
錦鯉至今已經有了1000多年的養殖歷史，錦鯉的祖先就是我們常見的食用鯉，錦鯉是鯉魚的一個變異雜交品種，是由于養殖環境變化引起體色突變，然后通過人工選育和雜交而培育出來。鯉科是所有魚種中最大的一科，有很多品種，可以根據鯉種的來源分類，也可以根據錦鯉的色彩、鱗片、花紋來分類。目前最常見的有紅白錦鯉，根據斑紋的形狀、數量等又可以分為一條紅錦鯉 、二段、三段、四段紅白錦鯉等等。
紅白錦鯉
紅白錦鯉是最正宗最原始的錦鯉，它的整個身體底色都是純白色的的，覆蓋了一些較深且邊緣清晰的紅色斑紋，而且沒有其他的雜色。紅白錦鯉的品種眾多，大概有20多個品種，根據特有的紅斑數量、紅斑所長的形狀和位置又可以分為：
1、一條紅錦鯉：從頭部開始一直到尾柄位置有一優美的紅色條帶，非常漂亮。
2、二段紅白錦鯉：在純白無暇的魚身上有兩段緋紅色的斑紋，像晚霞一樣紅，光彩鮮艷。
3、三段紅白錦鯉：魚的背上有3段紅色的花斑紋。
4、四段紅白錦鯉：在銀白色的魚體上長有4段顏色鮮艷的紅斑。
5、閃電紋紅白錦鯉：從頭部位置到尾巴末端有一條紅色斑紋，而這個斑紋形狀彎彎曲曲就好像是雷雨天時閃電的形狀，因此叫閃電紋紅白錦鯉。
6、富士紅白錦鯉：紅白錦鯉的頭上有銀白色粒狀斑點，就好像是富士山頂的積雪。但是此斑點會隨著魚長大而消失，一般只出現在1齡或2齡魚體上。
7、拿破侖紅白錦鯉：顧名思義，就是魚體腹部兩側的斑紋跟法國統治者拿破侖佩戴的帽子十分相似。
8、御殿櫻錦鯉：魚體背部兩側均勻的分布著小顆粒紅斑紋，它們聚集在一起跟葡萄的形狀很像。
三色錦鯉
大正三色與昭和三色都是有紅、白、黑三種顏色的斑紋組成。其主要的區別是：大正三色是頭部沒有黑斑，純白的魚體上的是紅、黑斑紋；昭和三色是頭部有黑斑，魚體上的是紅、白斑紋。大正三色的黑斑呈圓形塊狀分布在魚體的上半部；昭和三色的黑斑則呈線紋或帶狀分布在魚體全身。大正三色的胸鰭有黑色條紋或者是全白的，而昭和三色胸鰭是圓形的黑色斑塊。
1、大正三色錦鯉：即身上有紅、白、黑三種顏色。錦鯉頭部只有紅斑，純白的身體上則有緋紅、烏黑兩種斑紋，胸鰭上也有黑色的條紋。這種品系也可分為10多種品種。
2、口紅三色錦鯉：即大正三色錦鯉的嘴唇上有一些小紅斑紋。
3、赤三色：大正三色錦鯉從頭、背一直到尾部有連續的紅斑紋，給人一種強烈視覺感應。
4、德國三色：是德國錦鯉的大正三色品種。另外有花紋皮光鯉是大各錦，金銀鱗與丹頂類分別是金銀鱗三色及丹頂三色。變種鯉分別是鹿子三色及三色秋翠。
5、昭和三色錦鯉：黑色的魚體上有紅色和白色的花紋，胸鰭的基部有黑色斑紋，而且它的頭部上一定會有大形的黑斑。這種品系下面有10多種品種。
6、烏鯉：整個魚體上都是黑色的或黑底上有一些白色斑或全黃斑紋。這種可分為4-5個品種。
別光錦鯉
魚體是白底、紅底或黃底的底色上，身上有黑斑紋。細致劃分大概有十多個品種。
1、白別光錦鯉：白別光就是白底上有黑斑，沒有紅色斑紋的大正三色錦鯉。魚體的黑白顏色十分清秀且分明，顏色濃郁，主要分布在魚體的軀干部和尾部。
2、赤別光錦鯉：魚的身體整個底色都是紅色，而且背部有黑色斑紋。
3、黃別光錦鯉：漆黑如墨的黑色斑點綴在金黃色的魚體上，稱為黃別光。
淺黃錦鯉
背部呈深藍色或淺藍色，一片一片的魚鱗外緣呈白色而在臉部的左右分布，腹部以及各鰭基部呈赤色的錦鯉稱為“淺黃”。 根據顏色來劃分為10余個品種。
1、水淺黃錦鯉：淺黃錦鯉中體色最淺的一種。
2、紺青淺黃錦鯉：它的魚體上是鮮艷的深藍色，而且是知名品種之一。
3、鳴海淺黃錦鯉：它的鱗片中央是深藍色的，鱗片的邊緣是淺藍色的，深淺兩色相互呼應，就好像是湖面的波光漪漣，波動人心。它是淺黃錦鯉中最有代表性的品種。
秋翠錦鯉
該品種為雜交品系，秋翠錦鯉的變種名叫“緋秋翠”，它的背部有各種緋紅色的花紋，價值相比更高。從魚的背上一直到魚尾有一條緊密排列的魚鱗，腹部的側線上也有一排魚鱗，其他部位沒有魚鱗。背上的鈷藍色和下腹部的紅色花紋相互交映，樂趣無窮，屬淺黃錦鯉的珍品。
細分大概有10個品種。
1、藍衣錦鯉：是淺黃錦鯉與紅白錦鯉雜交的后代品種。紅色斑紋上略帶一些淺黃色，而紅色斑紋上的鱗片后緣處又有半月形的藍色網狀花紋，非常特別，是錦鯉中比較受歡迎的品種之一。
2、墨衣錦鯉：就是在紅白錦鯉的紅斑上浮現出一些黑色的斑紋。
3、衣三色錦鯉：在大正三色錦鯉的紅色斑紋上凸顯出藍色的斑紋，它是是藍衣錦鯉與大正三色錦鯉交配繁殖的品種。
4、衣昭和錦鯉：在昭和三色錦鯉的紅斑上有藍色斑紋出現，是藍衣錦鯉與昭和三色錦鯉交配產生的品種。
變種鯉
它包括黃鯉、茶鯉、烏鯉、綠鯉等二十多個品種。
1、黃金錦鯉：它的全身都是清一色的金黃色，大概可以分為二十多個品種。
2、山吹黃金錦鯉：魚體為純黃金色，亮閃閃的，還會發出金黃色的光芒,而且魚鱗排非常列整齊。
3、桔黃金錦鯉：魚體呈純桔黃色，而且顏色鮮艷。
4、灰黃金錦鯉：魚體呈銀灰色，沒有鱗片。
白金錦鯉
整個魚體都是呈銀白色。
花紋皮光鯉
黃金錦鯉與其它品系交配產生的品種，其它品種中不包含烏鯉。常見的大概有10多個品種。
光寫錦鯉
寫類錦鯉與黃金錦鯉交配產生的品種。
金銀鱗錦鯉
全身有金色或銀色鱗片交替的錦鯉。
丹頂錦鯉
像丹頂鶴一樣頭頂有紅色的斑紋，而且斑紋呈圓形，身上其他部位都沒有紅斑。
1、丹頂紅白錦鯉：它的全身呈銀白色，只有頭頂有一塊為圓形的鮮艷紅斑，銀裝素裹，紅色點睛，堪稱一絕。
2、丹頂三色錦鯉：全身潔白，頭頂也有一塊鮮艷的圓形紅斑，魚體上帶有一點烏色的斑紋，既艷麗又素雅，非常漂亮。
3、丹頂昭和錦鯉：頭頂生有一塊紅色的斑紋，而魚體又是昭和三色錦鯉的斑紋，兩種結合相結合而成。