很多人用微生物，很多人問哪個微生物最好?其實EM被日本比嘉照夫教授發明之后，還沒有出現更好的復合菌配方。EM就是乳酸菌，光和菌，酵母菌等按照各自的特性組合在一起，到達最佳作用，這個配方把每種菌的優點缺點都考慮到，互相配合，是非常復雜的配方。把EM比喻成常規人民警察，里面有消防、武警、特警、公安、交警等，而其它單一菌種就是特種部隊了。在平時的常規調水，浸泡飼料，內服改善，EM都非常好，但是如果水出現問題，用一些單一菌種產品會更快。比芽胞桿菌，乳酸菌等微生物菌種。
一、EM菌的機理與作用
EM菌種發酵液滲入水體后?，能抑制病原微生物和有害物質，調整養殖生態環境，提高水中溶氧量，促進養殖生態系中的正常菌群和有益藻類活化生長，保持養殖水體的生態平衡;拌入餌料投喂，直接增強魚類的吸收功能和防病抗逆能力，促進健壯生長。EM菌種發酵液中的光合菌還能利用水中的硫化氫、有機酸、氨及氨基酸兼有反硝化作用消除水中的亞硝酸銨，從而凈化養殖池中的排泄物和殘餌，改善水質，減少魚病。主要作用為：
1、減少病原微生物和不良藻類;明顯增強養殖對象的免疫力和抗病性，提高成活率。 2、浮游動物、有益藻類增多，特別是紅蟲明顯增多。 3、穩定和改善水質，水體清爽，不臭不腐，無硫化氫、氨氣等異味，能見度在25-50厘米的時間長且穩定，換水時間延長2倍。 4、魚蝦糞、下腳料等不會變成淤泥而呈散沙狀。 5、促進生長，增重率明顯提高。
二、菌種發酵液在水產養殖的具體用法
1、池塘養魚 ⑴15天潑灑一次(下雨時潑灑效果最佳)。每畝用EM菌種發酵液1?公斤。?⑵魚飼料處理：魚飼料可用200倍EM菌種發酵液稀釋液噴灑，噴濕為度，馬上投喂，以免散開。⑶糞便處理：EM菌種發酵液1∶糞便50?的比例發酵后投入水體。?⑷魚病防治：魚浮頭或泛塘，每畝用EM菌液2公斤制成稀釋液均勻潑灑水面，隔2天再潑1次。
2、特種水產養殖(甲魚、蝦、鰻魚、桂魚等) ⑴環境處理：放水前一周，用100?倍EM菌液代替石灰等均勻噴灑凈化環境。放養前3?天，用EM菌種發酵液稀釋液潑灑水面，濃度為20萬分之一;每10-15-30天噴灑一次，水質較差的地方應加大濃度縮短潑灑間隔時間。⑵調節水質：一天兩次高密度換水的水池，不宜直接潑灑，而應潑在增氧機旁或進水口，通過機器和水流作用擴散有益微生物，以利最短時間分解有害物質，盡快穩定水質。土塘海水養鰻宜在每次換水后潑灑EM菌液稀釋液(濃度同上)。蝦類、甲魚等，一月潑灑稀釋液2-3次，發病季節適當增加用量。⑶魚飼料加工?：用100倍EM菌種發酵液稀釋液與粉狀飼料一起攪拌均勻，成團狀飼喂。投喂新鮮動物性飼料的甲魚池，可先把料鉸碎，再和配合飼料、100?倍EM菌種發酵液稀釋液一起攪拌均勻飼喂。⑷食臺處理：每次飼喂前檢查食臺，用200?倍EM菌種發酵液稀釋液清掃凈化食臺。
3、鮑魚養殖 (1)按池水量20?萬分之一配制EM菌種發酵液發酵液潑灑水面，視水質確定間隔時間。(2)用100倍EM菌種發酵液發酵液浸泡海帶(先切碎)數小時后投喂。用EM菌種發酵液后，鮑魚健壯不生病，換水時間延長1?倍。
4、水產品保鮮 水產品保鮮水槽每隔1-2?天噴灑一次500?倍EM菌種發酵液稀釋液，可延長水產品活鮮期和保持體表光潔喜人。
三、EM菌種發酵液在水產養殖的注意事項
1.EM菌種發酵液不要與化學藥劑同時混用。若混用造成池水變臭，要立即換水，再按技術要求用EM菌種發酵液拌料投喂和稀釋液噴灑。
2.EM菌種發酵液飼料須保持新鮮，喂養時即配即喂，混合1?次喂1?天?，全部喂完?。如有剩余應密封保存，防止變質。