目前人工養殖黃鱔常見的疾病有水霉病、細菌性腐皮病、赤皮病、出血病、腸炎病、毛細線蟲病、隱鞭蟲病、萎癟病、錐體蟲病、棘頭蟲病、水蛭病等。黃鱔發病之初往往難以發覺，一旦發病癥狀明顯，再進行治療不但操作麻煩，而且會給養殖生產帶來一定的經濟損失。故人工養殖黃鱔必須按“全面預防，積極治療”的方針，采取“無病先防，有病早治，防重于治”。在實際操作中要把好“三關”：其一是把好環境關;其二是把好消毒關;其三是把好管理關。下面將常見病的防治介紹如下：

腸炎病防治

加強飼養管理，按“四定”投餌，不投喂腐敗變質飼料，防止饑飽無度。定期用15克/立方米～20克/立方米生石灰或1克/立方米～2克/立方米漂白粉全池潑灑消毒。每50千克病繕用大蒜頭500克、食鹽250克搗爛拌餌投喂，連用3天～6天。

腐皮病防治

鱔魚池用生石灰徹底消毒，消滅病原體。保持水質清新，定期用1克/立方米～1.2克/立方米的漂白粉或15克/立方米～20克/立方米生石灰全池潑灑消毒。在鱔魚池里放養幾只蟾蜍(俗稱癩蛤蟆)，已發病的鱔魚池，可用1只～2只蟾蜍，將頭皮剝開，系于繩上，在池中往返拖幾次，2日～3日即有明顯好轉。

赤皮病防治

捕撈、運輸、放養操作細致，盡量避免魚體受傷。定期換水、消毒，保持水質清新。用1克/立方米～1.2克/立方米漂白粉潑灑，連用3天。用金霉素每毫升0.25個單位浸浴病鱔。

萎癟病防治

同一鱔魚池規格整齊，防止爭食。放養密度適宜，密度過大，應及時分池。飼料要求營養全面、豐富，投均勻，滿足鱔魚攝食生長。

水霉病防治

鱔魚池用生石灰徹底清塘消毒。捕撈、運輸、放養操作細致，盡可能避免魚體受傷。用30克/升～50克/升的食鹽水或10毫克/升的高錳酸鉀浸浴患病鱔魚5分鐘～10分鐘。

毛細線蟲病防治

用生石灰徹底清塘，殺死蟲卵。每50千克鱔魚用90%晶體敵百蟲5克～7.5克拌餌投喂，每天1次，連用6天。用貫眾、荊芥、蘇梗、苦楝樹根皮(16∶5∶3∶5)中草藥合劑，按每50千克鱔魚用藥290克，加3倍的水煎煮至原水量的1/1，取藥汁拌餌投喂，每天1次，連續用藥6天。

棘頭蟲病防治

用生石灰徹底消毒或將池水排干，暴曬，殺死中間寄主，切斷傳播途徑。用90%晶體敵百蟲每50千克鱔魚5克～7.5克拌餌投喂，每天1次，連續投喂6天，同時用0.5克/立方米～0.7克/立方米晶體敵百蟲全池潑灑。