從蜂群中抽出的巢脾，如果保存不好，常常會發霉，受巢蟲咬蛀。保管不當還會引起盜蜂和鼠害等。巢脾從蜂群中撤出后，應及時對染病巢脾予以消毒或淘汰化蠟，其余巢脾按蜜脾、粉脾、空脾分類裝箱，保存于清潔、干燥、密閉性較好的倉庫雄蜂蛹菜譜中。特別在存放前，要對巢蟲進行嚴格防治，防治方法有：二氧化硫熏殺和二硫化碳熏蒸，以及冰醋酸熏蒸法。
二氧化硫熏殺法是用一帶窗口的空巢箱作底，上面放5～6層繼箱，巢箱中放上一塊瓦片。第1層繼箱只放6張巢脾，中間留空，為硫磺安全燃燒空間。上面繼箱各放8～9張巢脾，箱體間用紙糊嚴。按每個繼箱3～5克硫磺粉量放入瓦片，并加入數塊燃燒的木炭，會立即產生二氧化硫氣體，并充滿箱體，用此二氧化硫氣體殺死蠟螟的幼蟲和成蟲。由于殺不死卵和蛹，過兩個星期需再熏l～2次。熏殺過程中，要通過繼箱窗口觀察木炭燃燒情況，直至熄滅為止，以防火災。
二硫化碳熏蒸法：二硫化碳常溫下可氣化，能殺死巢蟲的卵、幼蟲和成蟲。防治一次即可，方便易行。方法是：在蜂箱上疊放5～6層繼箱，每層放8～9張巢脾，最上層放6張巢脾，中間空出部分放一容器或吸水性強的厚紙盛放液體二硫化碳，用量為每個箱體3毫升。利用二硫化碳自然揮發，密度比空氣大而自然下沉的特點，從上往下熏殺。注意箱體間縫隙要用紙糊嚴。二硫化碳對人體有毒、易燃，放藥時，人要站在上風口并戴口罩，不要靠近火源。
冰醋酸熏蒸法：用80%～98%的冰醋酸，每箱10～20毫升灑在布條上，密閉熏蒸3～5天，可有效殺死蠟螟的幼蟲和卵，但不能殺死蛹和成蛾，熏蒸前應清除蜂箱內蠟螟的蛹和成蛾。