在青蝦的苗種階段，特別是變態時期的幼體階段，較常見的是寄生性疾病，如累枝蟲、聚縮蟲等在蝦體上寄生，影響青蝦的蛻殼變態、嚴重時會因此死亡，降低苗種培育成活率。防止該病的發生主要在于水質的調控，經常保持水質清爽，并具有一定的肥度，防止水體老化。
在抱卵蝦的培育階段，主要是防止敵害生物的侵襲，如水老鼠、蛇類等吞食親蝦，必要時網箱上可使用蓋網。注意在網箱中投足飼料，防止缺飼引起青蝦自相殘殺、殘食同類腹部的卵粒和游泳足，導致親蝦死亡。
爛鰓病（黑鰓病）
(1)癥狀。病蝦鰓絲發黑，局部有霉爛。
(2)病因。蝦鰓部被霉菌、細菌侵蝕，致使鰓部受損；池底重金屬如銅含量過高，蝦會發生銅中毒，鰓部呈現黑色素沉淀，影響呼吸；長期缺乏維生素C，使蝦體內生化反應無法進行，導致蝦體瘦弱死亡。
(3)治療方法。
①霉菌引起的黑鰓病可用漂白粉，按每立方米養殖水體2克的用量，溶解于水中，全池潑灑。
②細菌性引起的黑鰓可每噸水用痢特靈2～3克浸洗。
③重金屬中毒引起的黑鰓要大量換水，并添加檸檬酸；在飼料中添加維生素C。
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