在孵化過程中，孵化管理人員通常可以選用以下四種方法來控制孵化的溫度。
1、“蛋溫”和“給溫”的區別：孵化溫度分“蛋溫”和“給溫”,“蛋溫”是指種蛋的表面溫度， “給溫”是指孵化機內空間的溫度。目前在孵化工作中，有兩種控溫方法，一種是測控機內空間溫度即“給溫”，一種是測控“蛋溫”。
2、測控機內空間溫度的孵化方法：過去生產的孵化機，溫度傳感器都是固定在機內空間里，只能測控機內空間溫度。但是種蛋在孵化的過程中，“蛋溫”和孵化機內空間的溫度是不一樣的，剛開始孵化時，種蛋不能產生溫度，要想達到“蛋溫”38度,孵化機內空間的溫度需要達到39度才行,，隨著胚胎日齡的增加,胚胎漸漸產生了體溫，這時候想保持“蛋溫”38度不變，孵化機內空間的溫度就需漸漸降下來，到了孵化后期，孵化機內空間的溫度降到37度，蛋溫就能達到38度以上。所以使用這種孵化機，要不斷調整孵化機內空間的溫度，才能達到種蛋的需要。另外，每臺孵化機內的溫度均勻度和均溫風機的風速等參數都不一樣，所以孵化人員不但要有孵化經驗，還要對所使用的孵化機有一定的使用經驗才行。目前多數孵化技術方面的書里介紹孵化溫度，都是按照這種孵化機特點來編寫的，所以有孵化溫度要“前高”“中平”“后低”等等說法。
3、看胎施溫：看胎施溫就是孵化人員定時抽查照蛋，根據標準照蛋圖的“蛋相”(參照 照蛋與 胚圖)與抽查照蛋時的“蛋相”的差距，來調整孵化溫度。溫度低，發育慢，溫度高，發育快，通過幾批次的看胎施溫，可制定出適合本機型、本品種的最佳施溫方案。種蛋在孵化過程中，每天的“蛋相”均不相同，但差異較小，實際運用時只要抓住三個主要階段即可。
4、測控“蛋溫”的孵化方法：是近幾年來新興的孵化方法，這種孵化方法要求孵化機的溫度傳感器直接放在種蛋上面，整個孵化過程中，孵化人員只根據所孵品種的需要設定一個孵化溫度，孵化機會根據蛋溫的變化來自動調整孵化溫度，沒有孵化經驗的人也能孵好，使用這種孵化機要用幾只體溫表多測幾個地方的溫度，把溫度傳感器放在溫度不高也不低的地方。每3-5天用照蛋器把溫度傳感器周圍的種蛋照一遍，確保溫度傳感器周圍的種蛋沒有死胚蛋，和機內其它地方的種蛋發育一致。