一般情況下，除賴氨酸、蛋氨酸外，色氨酸是畜禽飼養中最易缺乏的必需氨基酸。對畜禽和人工養殖的魚類，色氨酸通常是第三或第四限制氨基酸，玉米、肉粉、肉骨粉中色氨酸含量很低，但在豆餅中含量相對較高。因此在玉米-豆粕型的日糧中，如缺豆粕易引起色氨酸的不足。從營養角度看是很重要的一種必需的氨基酸，在普遍添加了蛋氨酸和賴氨酸的日糧中，色氨酸添加更顯重要。
雛雞及仔豬易缺乏色氨酸，色氨酸在仔豬人工乳中應用普遍。另外，色氨酸的代謝產物5-羥色氨酸在動物體有抗高密度、斷奶等應激作用。在低蛋白飼料中添加色氨酸，對提高畜禽增重、改善飼料效率十分有效。一般添加量為0.02%～0.06%。色氨酸在動物體內可轉變為煙酸，轉化效率在豬體內為 50-60：1。