原料的合理選擇
飼料原料是加工飼料的基礎，選擇原料首先要保證原料的90%來源于已認定的綠色食品產品及其副產品，其它可以是達到綠色食品標準的產品;其次，要注意選購消化率高、營養變異小的原料。據測定，選擇高消化率的飼料至少可以減少糞尿中5%氮的排出量。再次是要注意選擇有毒有害成分低、安全性高的飼料，以減少有毒有害成分在畜禽體內累積和排出后的環境污染。
飼料的精準加工
飼料加工的精準程度對畜禽的消化吸收影響很大，不同的畜禽對飼料加工的要求是不一樣的。李德發(1994)報道，豬飼料顆粒在700μm-800μm之間，飼料的轉化率最高。
采用膨化和顆粒化加工技術，可以破壞和抑制飼料中的抗營養因子、有毒有害物質和微生物，改善飼料衛生，提高養分的消化率，使糞便排出的干物質減少三分之一。
配制氨基酸平衡日糧
氨基酸平衡日糧，是指依據“理想蛋白質模式”配制的日糧。即日糧的氨基酸水平與動物的氨基酸水平相適應的日糧。據報道，在滿足有效氨基酸需要的基礎上，可以適當降低日糧的蛋白質水平。有研究資料表明，畜禽糞便、圈舍排泄污物、廢棄物及有害氣體等均與畜禽日糧中的組成成分有關。
將豬日糧中的蛋白質含量每降低1%，氮的排出量則減少8.4%。如果將日糧中的粗蛋白含量從18%降低到15%，即可將氮的排放量降低25%。如果將雞的日糧中蛋白質減少2%，糞便排氮量可減少20%。
糞便污染的惡臭主要由蛋白質的腐敗所產生，是日糧中營養物質吸收不全造成的，如果提高日糧蛋白質消化率或減少日糧蛋白質供應量，那么惡臭物質的產生將會大大減少。這不僅可以節省蛋白質資源，而且也是從根本上降低畜禽糞便氮污染的重要措施。