1、自然變異
飼料原料養分含量的變異系數平均為10%，一般在10%—15%范圍內是正常的，這是由于地區、年份、品種、土壤肥力、氣候條件及收割時間不同而引起的，這就使得同一種原料其營養成分含量有所不同。我國各地都有玉米種植，尤以東北、華北和西南各省較多，東北地區普遍種植硬粒型玉米，華北多種植馬齒型玉米。在粗蛋白含量上硬粒玉米比馬齒型高0.2個百分點。
2、摻假
粒度細的原料最容易摻假。一般來說，摻假不僅改變原有原料的化學成分，降低其營養價值，而且嚴重時會出現毒性。如魚粉，由于魚粉價格昂貴，是容易被摻假的飼料原料之一，粉碎較細的貝殼、骨殼、棉籽餅、菜子餅、羽毛粉、鞣革粉及尿素等都可以摻入。總之，現在市場上原料混雜，很多出現摻假現象，因此養殖戶在購買時應多加注意。
3、加工
由于加工方法和加工技術不同，也會導致原料質量出現差異。例如，常見的原料——棉耔餅、粕以及菜籽餅、粕等，加工時是否脫殼及脫殼程度高低均影響其質量。另外，骨粉、羽毛粉、血粉等加工技術不同，營養價值差別也很大。