菌糠是指栽培各種菌類以后剩下的廢料。實踐表明：每 100千克培養料，收獲100 千克鮮菇后，還可以得到60千克廢料。這些廢料均含有大量菌絲體、蛋白質及其他營養物質，被稱為“菌糠蛋白”。經適當加工處理，可以作為飼料或添加劑，完全可以替代一部分飼料用糧及其他營養元素。
1平菇、鳳尾菇菌糠飼料
1.1 研究表明，利用棉籽殼栽培鳳尾菇，菌糠中的粗蛋白從種菇前的5.65%增加到7.9%，粗纖維從種菇前的51.45%減少到9.32%;脂肪略有增加;還原糠從2.1%增加到3.9%，總糠從19.8%增加到25.2%。以棉籽殼栽培平菇后，菌糠中粗蛋白比純棉籽殼增加9.30%、無氨浸出物增加 9.74%、鈣增加59.26%，粗纖維含量則降低17.37%。以稻草栽培鳳尾菇，每百千克干物質中：17.56%～26%轉化為子實體，18.91%～42.27%變為熱能消耗，則還有40.17%～55.08%約近一半左右留在料中。分析平菇、鳳尾菇菌糠中的營養狀況，為綜合利用這些資源提供了理論依據。
1.2據有關報道，在每千克含消化能2.762千卡，粗蛋白14.78%，可消化粗蛋白113 克的生長肉豬配合飼料中，以45%的平菇菌糠代替等量麩皮，進行比較飼養，菌糠組平均增重60.4 克，日增重504 克，分別比麩皮組提高13.96%和14.03%。
1.3用菌糠養豬，每增重1千克，養豬成本下降35%;菌糠飼料喂豬，平均每頭豬可節約糧食75 千克左右，節約成本50元。凡投料2000千克的食用菌專業戶，可得菌糠約650千克，可供養3頭肥豬，僅此一項可增產值1200多元。
2金針菇菌糠飼料
用棉籽殼栽培金針菇后，其菌糠能滿足生豬生長發育需要，很適合飼養瘦肉型生豬，使生豬增重率達30%～70%，且肉質好。
3香菇菌糠飼料
香菇菌糠含粗蛋白8.76%、粗脂肪0.62%、粗纖維30.0%、灰分7.93%。每千克菌糠中含鈣10.86 克、磷3.6克、鉀4.04 克、鈉8.7 克、銅0.0049克、鎂1.58 克、鐵0.69克、鋅0.06克、錳0.0774 克。對菌糠進行科學地配方，可喂養豬、雞、鴨、鵝，使雞、鴨等家禽，產蛋率提高10%～15%。