小麥的能值低于玉米，可能會導致日糧能量偏低。據NRC的標準，12%水分的小麥禽代謝能為3040大卡/kg，而14%水分的優質玉米禽代謝能值為3240大卡/kg，比小麥高出200大卡。據大量實驗表明，在添加足量復合小麥酶之后，可提高小麥的禽代謝能值140~230大卡/kg，已經基本與優質玉米相當。而市售玉米，特別是山東本地玉米，水分往往在16%左右甚至更高，而且其中雜質較多，霉變狀況時有出現，其代謝能甚至不足3150 大卡/kg，而市售小麥的水分多在10%~12%之間，其代謝能值甚至比玉米還略有優勢。
亞油酸問題。玉米中油脂含量高于小麥，使用小麥型日糧，可能會出現亞油酸不足的現象，可通過添加菜餅、油脂等方法解決。
維生素含量問題。玉米中含有豐富的VE，而B族維生素含量較低;而小麥中含有豐富的B族維生素，而VE含量偏低。這個問題可以提高調整日糧中VE的添加量來解決。6、對雞蛋品質的影響。由于小麥中色素含量較少，會間接影響到蛋黃顏色，使蛋黃顏色稍淺，但對雞蛋的風味無不良影響。所以對于不著重要求蛋黃顏色的普通商品蛋雞，可以不考慮此影響，而某些品種雞，可通過添加食用色素等來解決。而由于小麥中含有豐富的B族維生素，有利于維持粘膜完整，提高蛋清粘稠度，并使蛋殼呈現誘人的光澤。
氨基酸平衡問題。優質玉米的粗蛋白含量為8.7%，而小麥的粗蛋白含量高達13.9%，在谷物類飼料中名列前茅，因此使用小麥替代玉米，同時要減少一部分豆粕用量。但對蛋雞來說，小麥的氨基酸比例不盡合理，主要是賴氨酸水平偏低。因此，在使用小麥型飼料時需要額外添加一定量的賴氨酸，同時將日糧中的粗蛋白水平略微提高，以數量換平衡。