一、土地還原法
畜禽糞便還田是我國傳統農業的重要環節，在改良土壤、提高農作物產量方面起著重要的作用。土壤在獲得肥料的同時凈化糞便，節省了糞便的處理費用。
二、腐熟堆肥法
堆肥發酵處理是目前畜禽糞便處理與利用較為傳統可行的方法，指用于處理有機垃圾。其原理是利用微生物對垃圾中的有機物進行代謝分量，并能產生有機肥料。運用堆肥技術，可以在較短的時間內使糞便減量、脫水、無害，取得較好的處理效果。糞便經過堆放發酵，利用自身產生的溫度來殺死蟲卵和病原菌，達到無害化處理目的。
三、飼料化技術(發酵處理)
糞便資源的飼料化，是畜禽糞便綜合利用的重要途徑。畜禽糞便含有大量未消化的蛋白質、B族維生素、礦物質元素、粗脂肪和一定數量的碳水化合物，特別是粗蛋白質含量較高，經發酵劑發酵后的糞便可成為較好的畜禽飼料資源。
四、生物分解法
利用蠅蛆、蚯蚓和蝸牛等低等動物分解畜禽糞便，達到既提供動物蛋白質又能處理畜禽糞便的目的。此法比較經濟，生態效益顯著。蠅蛆、蚯蚓和蝸牛都是營養價值很高的動物性蛋白質飼料。先將牛糞與飼料殘渣混合堆漚腐熟，達到蚯蚓產卵、孵化、生長所需的理化指標，然后按適當厚度將腐熟料平鋪于地，放人蚯蚓讓其繁殖。
五、化糞池。
指的是將生活污水分格沉淀，及對污泥厭氧消化。化糞池是處理糞便并加以過濾沉淀的設備，其原理是：固化物在池底分解流走，防止了管道堵塞，給固化物體有充足的時間水解。化糞池是一種利用沉淀和厭氧、發酵的原理，去除生活污水中懸浮性有機物的處理方法。生活污水中含有大量糞便、紙屑、病原蟲等懸浮物。污水進入化糞池經過12-24小時處理，沉淀下來的污泥經過3個月以上的厭氧消化，使污泥中的有機物分解成穩定的無機物，并使處理的污水得以凈化
六、能源化技術
制作沼氣池。有機物質在厭氧環境中，在一定的溫度、濕度、酸堿度的條件下，通過微生物發酵，產生沼氣。沼氣細菌分解有機物，達到糞便無害化處理的目的。畜禽糞便中含有大量的能量，利用發酵沼氣不僅可使畜禽糞便中的能量轉化成可燃氣體，還可避免糞尿的肥分損失。