清掃 雞出欄后，將雞糞、墊料、頂棚灰塵等清掃出舍，可移動的設備和用具也要搬出雞舍，并在指定地點曝曬、清洗和消毒。雞舍地面、墻壁、頂棚及附屬設施上的灰塵、糞便、墊料、飼料、羽毛等，都要清掃到距雞群一定距離的處理場。為防止病原體擴散，應適當噴灑消毒液。對不易清洗干凈的裂縫、椽子背面、排氣孔等地方，也要一處不漏地徹底清掃干凈。
水洗 在清掃的基礎上進行水洗。要使消毒藥液發揮效力，徹底刷洗干凈是有效消毒的前提。所以，地面上的污物經水浸泡軟化后，應用硬刷刷洗，如能采用動力噴水泵以高壓沖刷更好。如果雞舍排水設施不完善，則應在一開始就用消毒液清洗消毒，同時對被清洗的雞舍周圍噴灑消毒藥。
干燥 一般在水洗后擱置1天左右使舍內干燥，如果水洗后立即噴灑消毒藥液，其濃度即被消毒面的殘留水所稀釋，有礙于藥液的滲透而降低消毒效果。
消毒 焚燒：用火焰噴射器對雞舍的墻壁、地面、籠具等不怕燃燒的物品進行火焰消毒，特別是殘存的羽毛、皮屑和糞便。熏蒸：關閉門窗和風機，按每立方米空間用甲醛 42毫升，高錳酸鉀21克對雞舍進行熏蒸消毒。噴消毒液：消毒液的噴灑次序應該由上而下，先房頂、天花板，后墻壁、固定設施，最后是地面，不能漏掉被遮擋的部位。常用的消毒藥有0.3%的過氧乙酸溶液、3%的燒堿溶液、3%的來蘇兒液等。注意消毒藥液要按規定濃度配制。雞舍角落及物體背面，消毒藥液噴灑量至少是每平方米3毫升。消毒后，最好空舍2～3周。