使用暖棚養雞，養殖戶管理方便，雞生長也快速飼養效率高。不過在使用該種養殖方法時雞容易患以下幾種疾病。
感冒
在寒冷的季節，暖棚內晝夜溫差大，如不采取保溫措施，雞極易受涼感冒。其防治措施：
采取保溫措施 通過調節通風口的大小及蓋、卷保溫草簾來調節暖棚內的溫度，晚間把草簾加蓋到棚膜的表面，必要時關閉天窗和通風孔。
采取加溫措施 寒冬夜間10時到凌晨4時，可采取人工加溫，以保持棚內溫度的穩定，縮小晝夜溫差，同時查找、堵塞漏風口，避免賊風侵襲。
慢性呼吸道病
空氣濕度大是塑料暖棚養雞的一個主要特點。夜間、陰天，特別是溫度低時，空氣的相對濕度甚至處于飽和狀態。在高溫高濕的環境中，雞顯得煩躁，呼吸困難，張口喘氣，病原微生物大量滋生繁殖，侵襲雞體，加之氨氣、硫化氫等有害氣體對呼吸道黏膜的刺激，極易誘發慢性呼吸道病，繼而發生腹水綜合征等，對雞群的危害極大。其防治措施：
選擇干燥地勢建塑料暖棚 暖棚要建在背風、向陽、地勢高的地方，地勢低洼、潮濕、積水的地方不可建棚。
保持棚內干燥、通風良好
一、棚頂應設有可關閉的天窗，后墻留通風孔。白天有太陽時應打開前坡草簾，待棚內溫度升高時再打開天窗和后墻的通風孔，進行排濕和排除有害的氣體，夜間視棚內溫度再酌情進行通風。
二、在棚內地面鋪些干沙，保持干燥。
啄癖癥
用暖棚養雞特別是養肉雞，如果不加強環境控制，雞極易出現啄肛、啄趾、啄羽等啄癖癥。冬季棚內通風不暢，棚舍內氨氣、硫化氫等有害氣體濃度過高，破壞雞的生理平衡，雞會因煩躁不安而互啄。另外，在晴朗的中午，光照度過高，容易引發啄食癖;飼養場衛生差，污泥積水若不及時清除，粘污羽毛，也可造成互啄現象;飼養密度過高也易引起互相啄食。其防治措施：
飼養密度要適宜 雞舍內應當保持適宜的飼養密度，一般以在3周齡以前每平方米飼養25只、3周齡以后15～20只的飼養密度為宜。還要按雞的大小、強弱分群飼養。
光照強度要適宜 暖棚內的光照強度若過高或過低，應采取遮陽措施加以調節，如使用遮陽網或間隙揭蓋保溫草簾。
要保持環境衛生 隨時清除舍內的積水和污泥，降低舍內有害氣體的含量，保持環境衛生，減少疾病發生。
要及時治療病雞 對已患有異食癖的雞，要進行隔離單獨飼養。對已被啄傷的雞，其傷口上可用魚石脂、磺胺軟膏、龍膽紫、碘酊等藥物進行及時消毒。
氨中毒
塑料暖棚內由于通風不良，積糞中的含氮有機物分解成氨氣，并蓄積在雞舍內，當達到一定濃度時，就會造成雞群氨中毒。病雞表現精神沉郁，食欲廢絕，雞冠發紫，口腔黏膜充血，流眼淚，結膜充血，部分眼瞼出現水腫或角膜渾濁，在臨死前抽搐、麻痹。剖檢病雞可見血液稀薄，氣管內充血，肺腫大變脆。其防治措施：
加強通風 一旦發現雞群氨中毒，應立即打開雞舍的天窗和通風口，加強舍內通風。
保持衛生 平時要定期清除舍內的糞便，以保持雞舍內清潔衛生，通風良好。
對癥治療 如果雞出現呼吸困難、咳嗽等病癥，可用抗生素治療。對中毒不明顯的雞，可用1∶3000的硫酸銅溶液給雞飲水或拌料，連用3天。