規模化肉鴨場需要建立生物安全體系，提高疫病防控的針對性和有效性，控制鴨只疫病。規模化鴨場生物要構建安全體系。生物安全是指將可傳播的傳染性疾病、寄生蟲和害蟲排除在外的安全措施，包括防止有害生物進入(或存活)和感染(或危害)禽群應采取的一切措施。這些有害生物包括病毒、細菌、真菌、原蟲、寄生蟲、昆蟲、嚙齒動物和野生鳥類。肉鴨場生物安全體系是系統化管理，可減少外界疾病因素，規模化肉鴨場可分別構建針對肉種鴨和商品鴨的生物安全體系，改變現有的簡陋飼養方式。
診斷技術的集成與優化
以生產中嚴重危害鴨健康的鴨病毒性肝炎、流感、副粘病毒、鴨瘟、鴨呼腸孤病毒、漿膜炎和大腸桿菌等疫病為重點。目前，上述疫病的診斷檢測主要包括臨床診斷和實驗室診斷。由于鴨疫病臨床癥狀逐漸復雜化、非典型化，臨床診斷往往不能得出正確結論，這時就需要引進實驗室診斷技術來確診。實驗室診斷技術主要有病毒分離技術、血清學診斷技術及分子生物學診斷技術。規模化肉鴨場引進上述疫病診斷檢測技術，進行集成與優化，可做到及時對癥治療。
凈化技術的集成優化
以生產中嚴重危害鴨健康的鴨病毒性肝炎、流感、副粘病毒、鴨瘟、鴨呼腸孤病毒、漿膜炎和大腸桿菌等疫病為重點。針對流行病學特點，集成優化凈化技術。疫病凈化技術集成要體現綜合性。應用技術是基礎，管理措施是保障，必須將二者綜合集成一個有機整體。既要加強免疫預防、監測診斷、應急撲殺等應用技術，逐級建立凈化核心群、繁殖群、生產群，也要加強及時淘汰、消毒滅源、無害化處理、檢疫隔離、生物安全等管理措施。疫病凈化具有反復性，需要建立疫病凈化大聯盟來鞏固。一方面疫病的傳播特點決定了疫病發生受環境影響極大，如果措施不到位，即使已經被凈化的疫病有可能卷土重來，疫病的發生易反復;另一方面因凈化工作的復雜性和長期性，容易讓企業產生畏難情緒，使其易出現反復。因此，規模化肉鴨場必須通過建立聯盟來提高凈化技術指導的針對性，確保凈化措施應用的持續性，鞏固凈化效果的長久性。
免疫技術的集成優化
動物免疫是在動物健康的情況下對動物接種某種抗原，使動物集體產生抗某種疫病的能力，是防止動物疫情發生的必要手段。但是受一些原因的干擾，在注射一遍后沒有達到免疫效果，從而使疫情大規模擴散，造成了不必要的損失。規模化肉鴨場免疫失敗的主要原因有：免疫疫苗質量問題，免疫程序不適合本場實際，免疫操作不規范等。規模化肉鴨場應該依托當地獸醫實驗室或科研機構對已有的疫苗進行免疫檢測技術和疫苗免疫效果評價技術的集成與優化，篩選符合本場實際的疫苗種類，改進免疫程序，提高免疫質量。