誤區之一：已經消過毒的就不會再發生傳染病了
經過消毒，并不一定就能達到徹底的消毒效果，這與選用的消毒劑和消毒質量有關。有許多消毒劑存在消毒盲區，況且許多病原體可以通過空氣、飛禽、老鼠等媒體進行傳播，即使再嚴密的消毒措施也很難全部切斷傳播途徑。因此，除了進行嚴密的消毒外，還要結合養殖情況，有計劃地進行免疫接種。
誤區之三：長期使用單一消毒劑
誤區之二：未發生疫病可不進行消毒
消毒的主要目的是消滅傳染源的病原體，疫病發生要有三個基本環節：傳染源、傳播途徑、易感動物。在畜禽養殖中，盡管有時沒有發生疫病，但如果不及時消毒、凈化環境，環境中的病原體就會越積越多，達到一定程度時，就會引發疫病流行。因此，消毒應注意三個環節：欄舍內(帶畜禽)消毒、舍外環境消毒(包括用具、車輛等)和飲水消毒，每周應不少于3次，環境消毒每周1次，飲水始終要消毒或保證清潔。
細菌、病毒對藥物會產生耐藥性，對消毒劑也可能產生耐藥性，因此最好用幾種不同類型的消毒劑交叉使用。
消毒是畜禽疾病防治的關鍵措施之一，作為養殖戶，一定要認識其重要性，用正確的消毒方法對畜禽及其環境進行嚴密消毒，防患于未然。
誤區之四：消毒劑氣味越濃，消毒效果越好
消毒劑效果的好壞，不取決于氣味，而是看它的殺菌、殺病毒的能力。有許多好的消毒劑，如雙季胺鹽類、復合碘類消毒劑是沒有什么氣味的，相反有些氣味濃的消毒劑，存在著消毒盲區，氣味濃對畜體呼吸道有一定的傷害，易引起呼吸道疾病。