一 藥物的濃度和作用時間
養殖戶一般都知道，消毒藥物的濃度越高，作用時間越長，消毒效果越好，但是濃度大、時間長會對組織的刺激性大。但如果濃度過低、接觸時間過短，又不能很好地達到消毒的目的。因此，養殖戶應根據消毒藥物的特性和消毒的對象，恰當掌握藥物濃度和作用時間。
二 環境溫濕度
在適當范圍內，溫度越高，消毒效果越好，溫度每增加10℃，消毒效果增強1～1.5倍，因此消毒通常在15～20℃的溫度下進行。另外，環境濕度也會影響消毒效果，濕度過大或者非常干燥都不能保證消毒效果。
三 環境中的有機物含量
消毒藥物的消毒效果與環境中的有機物含量是成反比的，如果環境中有機物的污物較多，也會影響消毒效果，因為有機物一方面可以掩蓋病原體，對病原體起保護作用，另一方面可降低消毒藥物與病原體的結合從而降低消毒藥物的作用，所以建議養殖戶在對雞舍消毒時，盡量清理干凈雞舍內的雞糞、墻壁上的污物，以提高消毒效果。
四 環境中酸堿度
環境中的酸堿度對消毒藥物藥效有明顯的影響，如酸性消毒劑在堿性環境中消毒效果明顯降低;表面活性劑的季銨鹽類消毒藥物，其殺菌作用隨pH值的升高而明顯加強;苯甲酸則在堿性環境中作用減弱;戊二醛在酸性環境中較穩定，但殺菌能力弱，，當加入0.3%碳酸氫鈉，使其溶液pH值達7.5～8.5時，殺菌活性顯著增強，不但能殺死多種繁殖性細菌，還能殺死帶芽胞的細菌;含氯消毒劑的最佳pH值為5～6;以分子形式起作用的酚、苯甲酸等，當環境pH值升高時，其殺菌作用減弱甚至消失;而季銨鹽、氯已定、染料等隨pH值升高而增強。