在實際工作中，應堅持定期、常規、預防消毒，每周至少2次以上。同時把握好消毒時機，在全進前、全出后、發病前后等都要按規定徹底消毒，還應注意輪換使用消毒藥物，以免作用單一。不可忽視周圍外環境消毒，尤其是進場通道、飼養員服裝、鞋、帽、靴、車等傳播途徑的消毒，切斷傳播源，保證消毒效果。關于消毒劑選擇，根據帶雞還是空舍，殺菌還是殺病毒等不同要求，合理選擇不同消毒藥。醇、季胺鹽、表面活性劑、染料、齒素類等只能殺滅細菌，而氯制劑、堿、氧化劑、過氧化物等可殺滅病毒。
應該注意消毒前做好準備，機械清除前應先將可拆卸的用具如食槽、水槽、籠具等拆下，運至舍外清掃、浸泡、沖洗、刷刮，并反復消毒。在打掃衛生之前，最好先用消毒藥物噴霧和噴灑，以免病原微生物隨塵土飛揚或順水流排出，擴散至相鄰的禽舍及環境中而造成污染。