熏蒸消毒最大的優點是藥物能均勻地分布到禽舍的各個角落，熏蒸消毒特別適用于對禽舍空氣的消毒。禽舍熏蒸消毒應注意以下八點：
1 消毒時禽舍要密閉 甲醛氣體含量越高，消毒效果越好。在熏蒸消毒之前，要先檢查禽舍的密閉性，如果有縫隙，應將其封嚴，以防影響消毒效果。
2 盛藥容器要耐腐蝕 高錳酸鉀和福馬爾林都具有腐蝕性，混合后反應劇烈。因此，盛放藥品的容器應足夠大，并應耐腐蝕。
3 配合其它消毒方法 因甲醛只能對物體的表面進行消毒，所以在熏蒸消毒之前應對禽舍進行機械性清除和噴灑消毒。
4 溫度和濕度要合適 采用福爾馬林與高錳酸鉀反應的方法進行禽舍熏蒸消毒時，舍溫一般不應低于18 ℃，相對濕度以60%～80%為好。當舍溫在26 ℃，相對濕度在80%以上時，熏蒸消毒效果最好。
5 濃度和比例要適當 禽舍消毒，一般按福爾馬林30 mL/m3、高錳酸鉀15 g/m3和水15 mL/m3計算用量較為適宜。
6 消毒方法應恰當 先將水倒入容器內，后加入高錳酸鉀，攪拌均勻，再加入福爾馬林。加入福爾馬林后人即離開。熏蒸容器應盡量靠近門，以方便人員迅速撤離。操作人員要避免與甲醛發生接觸。
7 確保消毒時間 一般禽舍熏蒸消毒，24 h后即可使用，如不急用，最好密閉2周后再使用，以確保效果。
8 消毒后要充分通風換氣 禽舍熏蒸消毒后，舍內甲醛味較重，因此，要通風換氣2天以上再使用。如果急用，可用氨氣中和甲醛，根據空間大小用氯化銨5g/m3、生石灰10g/m3、75 ℃熱水10mL/m3，混合后放入容器內，即可放出氨氣。30分鐘后打開禽舍門窗，通風30～60分鐘后即可使用。