河蟹一生中的大部分時間是在底泥中度過的，蟹池底質差，不僅對成蟹的色澤等外觀品質有直接影響，而且不利于蟹病防治。 蟹池中淤泥過多，有機質氧化分解，會消耗大量的氧，造成池水缺氧，水質惡化，尤其是在夏秋河蟹生長高峰期，很容易造成蟹缺氧死亡。有機物分解還產生氨、硫化氫、甲烷、有機酸等可能引起河蟹中毒的物質，不利于河蟹生長。 對蟹池底質進行調節與改良，是養蟹管理的重要內容，應常抓不懈。首先應做好清淤、曬塘工作。利用冬春蟹種放養前的空閑時間，抽干池水，最好將淤泥取出池外，池底經冰凍、日曬不少于1個月。在蟹種放養前每畝用優質生石灰100-150公斤，化開后對池底全面潑灑，隔日用竹耙翻動，將石灰與底泥混和，殺滅敵害和微生物，固淤。在蟹池中種植根系著生于底泥中的挺水植物（茭白、蘆葦等）和沉水植物（伊樂藻、苦草、輪葉黑藻等），對改良底質也有很大作用。有條件的可以于冬春在蟹池中種一茬黑麥草，或者養蟹與種植輪流進行。還可以在養殖期間施用光合細菌（PSB）、復合微生態細菌（EM）等生物改良劑，改善底質。