在青蝦的苗種階段，特別是變態時期的幼體階段，較常見的是寄生性疾病，如累枝蟲、聚縮蟲等在蝦體上寄生，影響青蝦的蛻殼變態、嚴重時會因此死亡，降低苗種培育成活率。防止該病的發生主要在于水質的調控，經常保持水質清爽，并具有一定的肥度，防止水體老化。
在抱卵蝦的培育階段，主要是防止敵害生物的侵襲，如水老鼠、蛇類等吞食親蝦，必要時網箱上可使用蓋網。注意在網箱中投足飼料，防止缺飼引起青蝦自相殘殺、殘食同類腹部的卵粒和游泳足，導致親蝦死亡。
(二)常見病的防治
1、爛鰓病（黑鰓病）
(1)癥狀。病蝦鰓絲發黑，局部有霉爛。
(2)病因。蝦鰓部被霉菌、細菌侵蝕，致使鰓部受損；池底重金屬如銅含量過高，蝦會發生銅中毒，鰓部呈現黑色素沉淀，影響呼吸；長期缺乏維生素C，使蝦體內生化反應無法進行，導致蝦體瘦弱死亡。
(3)治療方法。
①霉菌引起的黑鰓病可用漂白粉，按每立方米養殖水體2克的用量，溶解于水中，全池潑灑。
②細菌性引起的黑鰓可每噸水用痢特靈2～3克浸洗。
③重金屬中毒引起的黑鰓要大量換水，并添加檸檬酸；在飼料中添加維生素C。
2、紅體病
(1)癥狀。發病初期青蝦尾柄色澤變紅，隨后紅色范圍逐漸擴大至整個腹部，最后影響到頭胸部而死亡。
(2)病因。致病原因多是操作不善而引起的，此病多數發生在投苗、除野、選捕后1～3天。
(3)預防方法。在投苗、除野、選捕操作中動作要輕，帶水作業，不要使蝦疊壓、滾移等。
3、藍綠藻病
(1)癥狀與病因。主要是一些底棲的藍綠藻類，在水質不佳、透明度過高而蝦類生長較慢時附著于蝦體表面，影響蝦的攝食活動，嚴重時使蝦不能蛻殼而死亡。
(2)防治方法。
①可通過施肥，繁殖浮游生物，降低池水透明度。
②水位保持在1米以上。
③全池施用茶麩(每噸水用藥15～20克)。
4、黑斑病
(1)癥狀。發病初期，青蝦的病灶呈較小的褐斑，以后逐漸潰爛，最后變成黑色。通常在鰓部和腹部，包括步足和游泳足，均帶黑色或黑斑。病蝦活力大減，或臥于池邊處于瀕死狀態。
(2)病因。主要因青蝦養殖池底部形成嚴重的還原層，使一些分解甲殼和腐屑的細菌大量繁殖而引起。
(3)防治方法。
①保持水質良好，必要時施生石灰或水質改良劑。
②平時小心操作，防止青蝦甲殼損傷，并注意放養密度，合理投喂飼料。
5、酥殼癥
(1)癥狀與病因。蝦殼異常粗糙，主要是水質、營養不良造成缺鈣或飼料中缺鈣元素而引起。
(2)預防方法。
①加強蝦池水質管理。
②在飼料中增加鈣的成分。
