肉雞飼養過程中，無論上批雞發病與否，雞舍內都會殘留病原體，污染環境。如果不徹底消滅這些病原體，很容易感染下一批雞。因此，做好空舍消毒工作，使每批雞都有一個干凈衛生的生活環境，才能杜絕各種疾病的循環傳播。
1.清理雞舍
清舍速度要快，清理要徹底。飼養設備，如料桶、飲水器、塑料網、燈泡、溫濕度計、工作服及其他用具等，應搬到舍外。徹底清除雞糞、羽毛、煤灰等污物，清掃房頂、墻壁和門窗等，做到舍內無塵。
2.清洗雞舍
清洗地面、墻壁和門窗等，舍內用具、設備用消毒藥浸泡后，用清水沖洗干凈、曬干;要求雞舍地面無積水，舍內任何表面都要沖洗到位，無死角，無污物附著。特別注意房頂的灰塵，要由上而下清洗干凈。設備及地面干燥后，方可消毒，最好使用歐福或安特2000消毒液。
3.檢修工作
維修雞舍設備、修補網床、檢修電路和供熱設備。設備至少能保證再養一批雞，否則應予以更換，損壞的燈泡要全部換掉，最好使用節能燈泡。
4.治理舍外環境
清除舍外排水溝雜物;清除雞舍四周雜草;做到排水暢通，不影響通風。修理舍外道路和清掃廠區，做到無雞糞、羽毛、垃圾。
5.雞舍消毒
把設備和用具搬進雞舍，關閉門窗和通風孔。要求做到封閉嚴密不漏風，噴灑消毒，消毒后10小時后通風，通風3-4小時后，關閉門窗。雞舍所有表面頂棚墻壁、網床，應選用高效、無腐蝕性的消毒藥消毒，按說明書比例配制。地面消毒應選用3%熱火堿水噴灑或撒生石灰。
6.熏蒸消毒
關閉門窗和通風口，檢查溫度和濕度是否符合要求。最好選用固體甲醛與高錳酸鉀熏蒸法。具體要求是舍溫24℃，濕度80%。上述熏蒸藥物按雞舍面積計算，如高錳酸鉀21克、福爾馬林42毫升、水21毫升。走廊每隔10米做一個熏蒸盆，盆內放高錳酸鉀，加水攪勻。然后從舍內最遠端依次快速倒入福爾馬林，完成后立即把門封嚴。空舍消毒期間不得有人、動物進入雞舍，熏蒸后24-36小時打開門窗和通氣孔，充分換氣。