孵化器環境的控制，巷道式孵化器內的溫度實際存在由低到高然后由高到低的變化，所以在控制溫度時應貫徹中間為主、入端為輔的原則，入端控溫在37.9℃-38.1℃，中間不能超過38 3℃，中間為從入端開始第三車的孵化溫度。
(1)孵化過程中溫度的調節。孵化中一般不要輕易改變溫度.要以平穩為主，大范圍的調溫應根據不同季節、受精率變化、種蛋日齡的變化進行調整，每次調整范隔最大不應超過O.1℃。在落完盤后，溫度設定必須上調，上調幅度以上次落盤溫度為準，以便孵化器內的溫度迅速恢復到所要求的標準溫度。每次上調幅度不應超過0.3℃。(2)孵化室內的通風要求。孵化室內最好為負壓通風，這樣有利于室內廢氣的排出，外界對孵化室內環境的影響較小。資料證明，通風量的大小不會影響胚胎的發育，20臺巷道式孵化器的孵化室內用一臺370W的風機就能夠保證排出孵化器內的廢氣，所以孵化室內應在保證溫度的前提下進行通風。
出雛器的環境控制，雖然胚胎在出雛器內只有3天時間，但這是保證雛雞是否健康的關鍵，所以胚胎在出雛器的3天不能忽視。(1)預溫及落盤管理。落盤的前一天應對出雛器進行熏蒸消毒：劑量為甲醛42mL/m3、高錳酸鉀21g/m3。值班人員應在落盤前3-5小時開始對出雛器進行預溫，計且檢查溫度傳感器、濕度傳感器工作是否正常，如不正常應及時通知維修人員、落盤前應提前做好落盤計劃，不同日齡的種蛋應落入不同位置的出雛器內，以符合不同日齡胚胎的孵化特點。落完盤后應在出雛器內放入兌水的甲醛進行自然揮發，甲：水=1：l，最后檢盤一下左右兩車位置是否齊平，然后關門開啟風機。(2)出雛期間的通風管理。出雛室的通風應銘記前期有保障，后期要適當的原則。第一天通風應以保證溫濕度為主，在此期間胚胎處于打嘴時期，所以保證出雛器內的濕度尤為重要，最宜相對濕度在65%～70%。第二天為雛雞的破殼時期，濕度在此處于最高階段，因此可以適當加大通風量，有利于廢氣的排出。從第二天后半發開始，應加大通風量有利于雛雞的通風換氣。