所有的豬舍都需要不斷地通風，以移除豬舍內的熱量、水分、灰塵、氣體及病原體，發酵床豬舍也不例外，即使在寒冷的黑龍江，這一點也尤為重要。
1、氣體流動的原理
氣體的流動是有一定的規律的。在無外力的影響下，密度高的氣體位于容器的下部，密度小的氣體位于容器的上部；氣體總是受熱后，體積膨脹，密度降低，氣體向上運動；氣體總是遇冷后體積減小，密度升高，氣體向下運動。
2、良好通風的重要因素
一是通過豬舍的氣體有一定的流速，二是進入豬舍的氣體要均勻地分布到豬舍內的所有區域，并且使新鮮空氣與室內的空氣充分混合。
3、發酵床豬舍內的氣體
發酵床養豬技術是利用微生物的作用，分解豬的糞尿產生大量的熱量，同時熱量將墊料內的水分蒸發到空氣中，通過豬舍的氣體交換，完成豬舍內的水汽和熱量的移除。
發酵床的發酵是一個耗氧過程，如果豬舍內通風不良，微生物的活動就會受到抑制，分解糞便的能力下降，就會導致發酵床上大量的糞便蓄積，厭氧菌種的活動能力增強，氨氣味道加重，豬舍內的二氧化碳的濃度增高等等不利的因素。
攜帶大量水汽的空氣密度小，會不斷向豬舍的上方運動，因此，豬舍的排氣孔要在豬舍的屋頂。如果豬舍沒有排氣口，濕熱的氣體就會在屋頂遇冷凝結成水珠，造成水珠反滴，造成發酵床的水分的二次蒸發，加大了發酵床的工作強度。