夏秋是各種病原微生物生長發育和大量繁殖的時候。在畜禽的飼養過程中，要特別注意對圈舍、用具、場地的消毒工作，否則，很容易發生各種傳染病。火堿是一種消毒效果很好的藥物。其2%至4%的溶液，可殺死繁殖型細菌和病毒；10%的溶液，24小時可殺死結核桿菌；30%的溶液，10分鐘可殺死炭疽芽胞。因此，火堿常用于雞白痢、雞瘟、鴨瘟、禽霍亂、豬丹毒、豬瘟、牛流感、結核病、布氏桿菌病、口蹄疫等傳染病的消毒。一般用2%至4%的溶液消毒畜牧場、肉聯廠等地面、畜舍、木制用具、運畜禽車輛等。
其溶液加熱后使用，可提高消毒效果。加入10%的食鹽，可增強殺滅芽胞的效力。火堿消毒效果雖好，但如果使用不科學，也會出現問題。為此，現將應注意事項介紹如下：
火堿對皮膚和器官有灼傷作用，不可用作畜體消毒，消毒時應將畜禽趕出舍外。進行消毒操作的人員，要注意防護，以免灼傷。
火堿對紡織品、鋁制品有腐蝕作用，此類用品不可用本藥消毒。
運輸畜禽的汽車、船只用火堿溶液消毒時，消毒后6至12小時，應用清水將消毒液徹底沖洗掉，以免受到腐蝕和損壞。