蟹池水面常出現綠色水華。這是由于銅綠微囊藻大量發生造成的，輕則使水體變綠色，重則產生一層綠膜。在池水有機物含量高的情況下銅綠微囊藻繁殖速度很快。繁殖到一定數量時，這種藻就會大量死亡，腐爛分解產生羥胺、硫化氫等有毒物危害河蟹。
預防綠膜產生，一是在清塘時要徹底清除淤泥，養殖過程中及時清理爛草、動物尸體、變質飼料等，降低水體中有機物的含量；二是常加注新水；三是高溫季節每隔10～15天全池潑灑生石灰10～15公斤；四是不施有機肥和氮肥。除治綠膜，平均水深1米每畝用螯合銅333～533克全池潑灑。
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